Чтобы "небыло" ложной информации, в случае, если товар закончится установите наличие "1" для основной карточки товара и уберите характеристику "размер", а также при редактировании карточки товара снимите галочку "возможность сделать заказ со страницы". - это исключит возможность создания заказа на товар, которого фактически нет в наличии.
При этом на странице раздела будет отображаться, что товар есть в наличии, а при заходе в карточку товара можно будет выбрать другие размеры - и там уже смотреть, какой именно из них в наличии.
Данная ситуация еще будет решаться, дорабатываться. Мы учтем ваше обращение как пожелание при доработке модификаций.